陈自明任建康(今南京)明道书院医学教授之职时,我国中医妇产科尚不完备,也没有专著。医书《大方脉》虽有涉及,但内容简略,或有论无方,或有方无论,医家难以为据。当时“医之术难,医妇人尤难,医产中数症,则又险而难”。因此,他潜心钻研中医妇产科,遍览医籍,博采众长,结合家传验方进行整理,于嘉熙元年(1237年)编成我国历史上最早的一部妇产科专著
《妇人大全良方》24卷。该书将妇产科疾病归纳为调经、众疾、求嗣、胎教、妊娠、难产、产后等8门,260余论。每门有病理分析和医治方案,内容丰富,条目清楚,论述简赅,处方精妥。其中妇人乳悬、乳疠、乳硬、带乳、乳位、吹乳诸症都有独到见解,特别是论述乳岩(癌)尤为精辟。此症当时尚未引起人们重视,他却详加论述,指出这种疾病“早期治疗或可内消;若不予治疗,乳将巉岩而崩烈如热瘤,或内溃深洞,血水滴沥,则后果险恶”。对癌症观察、研究先于世界各国。《妇人大全良方》,集宋以前妇产科医术之大成,为宋、元、明、清,以至现代医学治疗妇科疾病的重要参考资料和开展这一学科研究的理论基础。
陈氏毕生从医,志行高洁,常说“世无难治之病,有不善治之医;药无难代之品,有不善代之人”。治病不论贫富,一视同仁,随到随诊,对特殊困难者,不取分文,其医德深为世人称道。